Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSG1

RNF165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF165Q6ZSG1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF165Q6ZSG1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF165Q6ZSG1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms