Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCBE1Q6UXH8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCBE1Q6UXH8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms