Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRNIPQ6NTE8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MRNIPQ6NTE8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MRNIPQ6NTE8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MRNIPQ6NTE8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRNIPQ6NTE8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRNIPQ6NTE8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MRNIPQ6NTE8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MRNIPQ6NTE8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MRNIPQ6NTE8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MRNIPQ6NTE8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms