Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF19Q5T6S3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF19Q5T6S3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF19Q5T6S3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms