Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CAMSAP1Q5T5Y3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CAMSAP1Q5T5Y3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CAMSAP1Q5T5Y3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CAMSAP1Q5T5Y3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms