Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFAIP8L3Q5GJ75 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms