Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COBLL1Q53SF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COBLL1Q53SF7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COBLL1Q53SF7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms