Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3L2Q3SX64 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3L2Q3SX64 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms