Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCOLCEQ15113 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCOLCEQ15113 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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