Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNAPC2Q13487 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNAPC2Q13487 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAPC2Q13487 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
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