Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CALCOCO2Q13137 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CALCOCO2Q13137 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALCOCO2Q13137 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
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