Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SREBF2Q12772 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SREBF2Q12772 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SREBF2Q12772 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SREBF2Q12772 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
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