Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMTOR4Q0VGL1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMTOR4Q0VGL1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMTOR4Q0VGL1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms