Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX4Q06945 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX4Q06945 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX4Q06945 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms