Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CSNK2A1P68400 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms