Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P62891 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P62891 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL39P62891 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P62891 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P62891 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P62891 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P62891 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P62891 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P62891 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P62891 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P62891 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P62891 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P62891 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P62891 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P62891 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P62891 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P62891 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P62891 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P62891 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P62891 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P62891 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P62891 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P62891 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL39P62891 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL39P62891 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P62891 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL39P62891 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL39P62891 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL39P62891 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms