Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HERVK_113P62684 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HERVK_113P62684 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERVK_113P62684 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERVK_113P62684 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms