Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1CAP62136 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1CAP62136 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms