Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAG2P55895 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAG2P55895 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAG2P55895 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAG2P55895 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAG2P55895 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAG2P55895 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAG2P55895 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAG2P55895 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAG2P55895 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAG2P55895 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAG2P55895 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAG2P55895 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAG2P55895 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAG2P55895 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAG2P55895 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAG2P55895 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAG2P55895 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAG2P55895 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAG2P55895 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAG2P55895 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAG2P55895 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAG2P55895 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAG2P55895 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAG2P55895 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAG2P55895 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAG2P55895 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAG2P55895 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAG2P55895 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAG2P55895 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAG2P55895 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAG2P55895 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAG2P55895 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAG2P55895 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAG2P55895 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAG2P55895 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAG2P55895 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAG2P55895 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAG2P55895 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAG2P55895 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAG2P55895 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAG2P55895 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAG2P55895 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAG2P55895 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAG2P55895 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAG2P55895 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAG2P55895 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAG2P55895 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAG2P55895 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAG2P55895 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAG2P55895 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAG2P55895 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAG2P55895 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAG2P55895 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAG2P55895 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAG2P55895 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAG2P55895 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAG2P55895 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAG2P55895 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAG2P55895 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAG2P55895 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAG2P55895 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAG2P55895 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAG2P55895 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAG2P55895 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAG2P55895 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAG2P55895 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAG2P55895 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAG2P55895 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAG2P55895 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RAG2P55895 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAG2P55895 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAG2P55895 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAG2P55895 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAG2P55895 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAG2P55895 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RAG2P55895 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms