Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VCPP55072 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPP55072 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPP55072 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VCPP55072 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VCPP55072 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPP55072 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPP55072 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPP55072 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPP55072 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPP55072 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPP55072 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPP55072 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VCPP55072 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPP55072 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPP55072 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPP55072 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPP55072 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPP55072 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPP55072 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPP55072 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPP55072 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VCPP55072 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPP55072 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPP55072 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPP55072 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPP55072 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPP55072 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPP55072 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VCPP55072 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPP55072 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPP55072 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPP55072 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPP55072 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPP55072 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPP55072 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPP55072 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VCPP55072 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCPP55072 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCPP55072 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCPP55072 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCPP55072 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCPP55072 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VCPP55072 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCPP55072 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VCPP55072 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPP55072 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPP55072 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPP55072 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPP55072 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPP55072 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPP55072 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VCPP55072 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPP55072 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPP55072 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPP55072 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPP55072 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPP55072 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VCPP55072 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPP55072 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPP55072 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPP55072 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VCPP55072 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPP55072 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPP55072 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPP55072 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPP55072 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPP55072 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPP55072 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VCPP55072 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPP55072 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPP55072 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPP55072 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPP55072 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPP55072 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VCPP55072 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPP55072 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPP55072 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPP55072 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPP55072 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPP55072 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPP55072 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VCPP55072 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VCPP55072 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VCPP55072 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VCPP55072 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VCPP55072 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VCPP55072 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms