Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATN1P54259 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATN1P54259 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATN1P54259 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATN1P54259 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATN1P54259 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATN1P54259 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATN1P54259 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATN1P54259 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATN1P54259 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATN1P54259 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATN1P54259 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATN1P54259 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATN1P54259 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATN1P54259 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATN1P54259 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATN1P54259 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATN1P54259 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATN1P54259 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ATN1P54259 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATN1P54259 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATN1P54259 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATN1P54259 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATN1P54259 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATN1P54259 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ATN1P54259 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATN1P54259 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATN1P54259 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATN1P54259 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATN1P54259 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATN1P54259 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATN1P54259 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATN1P54259 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATN1P54259 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATN1P54259 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATN1P54259 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATN1P54259 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATN1P54259 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATN1P54259 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATN1P54259 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATN1P54259 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATN1P54259 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATN1P54259 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATN1P54259 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATN1P54259 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATN1P54259 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATN1P54259 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATN1P54259 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATN1P54259 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATN1P54259 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATN1P54259 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATN1P54259 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATN1P54259 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATN1P54259 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATN1P54259 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATN1P54259 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATN1P54259 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATN1P54259 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATN1P54259 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATN1P54259 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATN1P54259 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATN1P54259 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATN1P54259 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATN1P54259 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATN1P54259 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATN1P54259 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATN1P54259 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATN1P54259 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATN1P54259 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATN1P54259 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATN1P54259 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATN1P54259 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATN1P54259 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATN1P54259 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATN1P54259 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATN1P54259 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATN1P54259 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATN1P54259 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATN1P54259 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATN1P54259 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATN1P54259 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATN1P54259 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATN1P54259 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATN1P54259 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATN1P54259 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATN1P54259 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATN1P54259 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATN1P54259 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATN1P54259 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATN1P54259 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATN1P54259 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATN1P54259 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATN1P54259 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATN1P54259 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATN1P54259 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATN1P54259 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATN1P54259 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATN1P54259 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATN1P54259 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATN1P54259 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms