Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF143P52747 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF143P52747 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF143P52747 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF143P52747 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF143P52747 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF143P52747 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF143P52747 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF143P52747 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF143P52747 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF143P52747 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF143P52747 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms