Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP11P51784 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP11P51784 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP11P51784 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP11P51784 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP11P51784 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP11P51784 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP11P51784 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP11P51784 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP11P51784 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP11P51784 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP11P51784 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP11P51784 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
USP11P51784 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP11P51784 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP11P51784 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP11P51784 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP11P51784 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP11P51784 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP11P51784 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP11P51784 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP11P51784 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP11P51784 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP11P51784 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP11P51784 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP11P51784 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP11P51784 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP11P51784 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP11P51784 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP11P51784 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP11P51784 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP11P51784 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP11P51784 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP11P51784 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP11P51784 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP11P51784 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP11P51784 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP11P51784 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP11P51784 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP11P51784 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP11P51784 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP11P51784 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP11P51784 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP11P51784 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP11P51784 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP11P51784 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP11P51784 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP11P51784 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP11P51784 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP11P51784 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP11P51784 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP11P51784 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP11P51784 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP11P51784 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP11P51784 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP11P51784 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP11P51784 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP11P51784 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP11P51784 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP11P51784 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP11P51784 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP11P51784 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP11P51784 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP11P51784 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP11P51784 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP11P51784 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP11P51784 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP11P51784 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP11P51784 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP11P51784 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP11P51784 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP11P51784 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP11P51784 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP11P51784 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP11P51784 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP11P51784 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP11P51784 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP11P51784 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP11P51784 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP11P51784 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP11P51784 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP11P51784 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP11P51784 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP11P51784 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP11P51784 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP11P51784 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP11P51784 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP11P51784 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP11P51784 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms