Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RANGAP1P46060 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
RANGAP1P46060 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
RANGAP1P46060 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RANGAP1P46060 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
RANGAP1P46060 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms