Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCIP41743 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCIP41743 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCIP41743 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms