Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKAP35790 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKAP35790 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKAP35790 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKAP35790 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKAP35790 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKAP35790 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKAP35790 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKAP35790 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKAP35790 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHKAP35790 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHKAP35790 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKAP35790 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKAP35790 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKAP35790 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHKAP35790 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHKAP35790 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKAP35790 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKAP35790 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKAP35790 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKAP35790 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKAP35790 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKAP35790 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKAP35790 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKAP35790 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKAP35790 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKAP35790 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKAP35790 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKAP35790 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKAP35790 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKAP35790 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHKAP35790 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHKAP35790 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHKAP35790 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHKAP35790 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKAP35790 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKAP35790 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKAP35790 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKAP35790 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKAP35790 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKAP35790 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKAP35790 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKAP35790 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKAP35790 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKAP35790 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKAP35790 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKAP35790 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKAP35790 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKAP35790 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKAP35790 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKAP35790 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKAP35790 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKAP35790 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKAP35790 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKAP35790 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKAP35790 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKAP35790 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKAP35790 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKAP35790 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKAP35790 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKAP35790 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKAP35790 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKAP35790 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKAP35790 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKAP35790 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKAP35790 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKAP35790 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKAP35790 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms