Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX11P35716 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX11P35716 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX11P35716 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX11P35716 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX11P35716 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX11P35716 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX11P35716 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX11P35716 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX11P35716 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX11P35716 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX11P35716 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX11P35716 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX11P35716 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX11P35716 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX11P35716 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX11P35716 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX11P35716 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX11P35716 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX11P35716 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX11P35716 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX11P35716 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SOX11P35716 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX11P35716 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX11P35716 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX11P35716 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX11P35716 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX11P35716 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX11P35716 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX11P35716 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX11P35716 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX11P35716 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX11P35716 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX11P35716 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX11P35716 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX11P35716 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX11P35716 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX11P35716 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX11P35716 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX11P35716 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX11P35716 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX11P35716 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX11P35716 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX11P35716 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX11P35716 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX11P35716 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX11P35716 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX11P35716 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX11P35716 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX11P35716 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX11P35716 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX11P35716 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX11P35716 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX11P35716 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX11P35716 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX11P35716 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX11P35716 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX11P35716 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX11P35716 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX11P35716 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX11P35716 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX11P35716 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX11P35716 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX11P35716 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms