Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALRP27797 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALRP27797 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALRP27797 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALRP27797 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALRP27797 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALRP27797 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALRP27797 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CALRP27797 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CALRP27797 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CALRP27797 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CALRP27797 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALRP27797 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALRP27797 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALRP27797 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALRP27797 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALRP27797 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALRP27797 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CALRP27797 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALRP27797 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALRP27797 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CALRP27797 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALRP27797 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALRP27797 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALRP27797 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALRP27797 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALRP27797 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALRP27797 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CALRP27797 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CALRP27797 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CALRP27797 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALRP27797 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALRP27797 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALRP27797 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALRP27797 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALRP27797 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALRP27797 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CALRP27797 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALRP27797 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALRP27797 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALRP27797 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALRP27797 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CALRP27797 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALRP27797 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CALRP27797 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALRP27797 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALRP27797 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CALRP27797 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALRP27797 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALRP27797 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALRP27797 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALRP27797 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALRP27797 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALRP27797 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALRP27797 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALRP27797 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CALRP27797 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CALRP27797 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALRP27797 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALRP27797 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALRP27797 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALRP27797 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALRP27797 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALRP27797 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CALRP27797 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CALRP27797 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CALRP27797 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms