Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA4P22748 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CA4P22748 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA4P22748 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CA4P22748 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA4P22748 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA4P22748 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA4P22748 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CA4P22748 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CA4P22748 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA4P22748 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA4P22748 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA4P22748 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA4P22748 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA4P22748 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA4P22748 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CA4P22748 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA4P22748 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA4P22748 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA4P22748 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA4P22748 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA4P22748 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA4P22748 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA4P22748 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CA4P22748 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CA4P22748 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CA4P22748 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CA4P22748 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CA4P22748 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CA4P22748 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CA4P22748 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CA4P22748 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CA4P22748 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CA4P22748 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CA4P22748 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CA4P22748 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA4P22748 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA4P22748 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA4P22748 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA4P22748 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA4P22748 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA4P22748 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA4P22748 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CA4P22748 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CA4P22748 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CA4P22748 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CA4P22748 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CA4P22748 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CA4P22748 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA4P22748 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA4P22748 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA4P22748 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA4P22748 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CA4P22748 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CA4P22748 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CA4P22748 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA4P22748 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA4P22748 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA4P22748 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA4P22748 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA4P22748 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CA4P22748 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CA4P22748 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CA4P22748 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CA4P22748 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA4P22748 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA4P22748 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CA4P22748 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms