Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NELFEP18615 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NELFEP18615 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFEP18615 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NELFEP18615 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NELFEP18615 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NELFEP18615 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NELFEP18615 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NELFEP18615 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFEP18615 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFEP18615 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFEP18615 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFEP18615 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFEP18615 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFEP18615 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFEP18615 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFEP18615 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NELFEP18615 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFEP18615 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFEP18615 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFEP18615 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFEP18615 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFEP18615 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFEP18615 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFEP18615 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFEP18615 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NELFEP18615 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFEP18615 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFEP18615 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFEP18615 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFEP18615 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFEP18615 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFEP18615 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFEP18615 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFEP18615 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFEP18615 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFEP18615 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFEP18615 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFEP18615 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFEP18615 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFEP18615 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFEP18615 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFEP18615 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFEP18615 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFEP18615 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFEP18615 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFEP18615 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFEP18615 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFEP18615 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFEP18615 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFEP18615 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFEP18615 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFEP18615 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFEP18615 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFEP18615 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFEP18615 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFEP18615 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFEP18615 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFEP18615 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms