Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB1P16220 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB1P16220 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB1P16220 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB1P16220 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB1P16220 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB1P16220 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB1P16220 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB1P16220 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB1P16220 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB1P16220 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB1P16220 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB1P16220 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB1P16220 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB1P16220 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB1P16220 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB1P16220 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB1P16220 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB1P16220 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB1P16220 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB1P16220 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB1P16220 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB1P16220 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB1P16220 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB1P16220 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB1P16220 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB1P16220 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB1P16220 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB1P16220 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB1P16220 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB1P16220 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB1P16220 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB1P16220 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB1P16220 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB1P16220 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB1P16220 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB1P16220 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB1P16220 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB1P16220 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB1P16220 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB1P16220 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB1P16220 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB1P16220 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB1P16220 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB1P16220 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB1P16220 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB1P16220 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB1P16220 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB1P16220 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB1P16220 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB1P16220 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB1P16220 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB1P16220 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB1P16220 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB1P16220 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB1P16220 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB1P16220 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB1P16220 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB1P16220 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB1P16220 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB1P16220 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB1P16220 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB1P16220 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB1P16220 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB1P16220 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB1P16220 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB1P16220 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB1P16220 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB1P16220 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB1P16220 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB1P16220 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB1P16220 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB1P16220 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB1P16220 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB1P16220 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB1P16220 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB1P16220 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB1P16220 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms