Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ITGB4P16144 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
ITGB4P16144 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ITGB4P16144 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms