Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM49P0CI25 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM49P0CI25 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM49P0CI25 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms