Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRNPP04156 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRNPP04156 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRNPP04156 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRNPP04156 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRNPP04156 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRNPP04156 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRNPP04156 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRNPP04156 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRNPP04156 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRNPP04156 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRNPP04156 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRNPP04156 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRNPP04156 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRNPP04156 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRNPP04156 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRNPP04156 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRNPP04156 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRNPP04156 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRNPP04156 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRNPP04156 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRNPP04156 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRNPP04156 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRNPP04156 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRNPP04156 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRNPP04156 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRNPP04156 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRNPP04156 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRNPP04156 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRNPP04156 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRNPP04156 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRNPP04156 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRNPP04156 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRNPP04156 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRNPP04156 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRNPP04156 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRNPP04156 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRNPP04156 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRNPP04156 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRNPP04156 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRNPP04156 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRNPP04156 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRNPP04156 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRNPP04156 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRNPP04156 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRNPP04156 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRNPP04156 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRNPP04156 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRNPP04156 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRNPP04156 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRNPP04156 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRNPP04156 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRNPP04156 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRNPP04156 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRNPP04156 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRNPP04156 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRNPP04156 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRNPP04156 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRNPP04156 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRNPP04156 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRNPP04156 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRNPP04156 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRNPP04156 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRNPP04156 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRNPP04156 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRNPP04156 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRNPP04156 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRNPP04156 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRNPP04156 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRNPP04156 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRNPP04156 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRNPP04156 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRNPP04156 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRNPP04156 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRNPP04156 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRNPP04156 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRNPP04156 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRNPP04156 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRNPP04156 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRNPP04156 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms