Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GABARAPO95166 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GABARAPO95166 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms