Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COQ9O75208 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COQ9O75208 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COQ9O75208 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COQ9O75208 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COQ9O75208 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COQ9O75208 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COQ9O75208 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COQ9O75208 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COQ9O75208 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COQ9O75208 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COQ9O75208 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COQ9O75208 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COQ9O75208 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COQ9O75208 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COQ9O75208 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COQ9O75208 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COQ9O75208 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COQ9O75208 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COQ9O75208 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COQ9O75208 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COQ9O75208 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COQ9O75208 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COQ9O75208 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COQ9O75208 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COQ9O75208 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COQ9O75208 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COQ9O75208 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COQ9O75208 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COQ9O75208 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COQ9O75208 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COQ9O75208 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COQ9O75208 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COQ9O75208 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COQ9O75208 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COQ9O75208 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COQ9O75208 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COQ9O75208 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COQ9O75208 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COQ9O75208 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COQ9O75208 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COQ9O75208 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COQ9O75208 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COQ9O75208 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COQ9O75208 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COQ9O75208 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COQ9O75208 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COQ9O75208 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COQ9O75208 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COQ9O75208 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COQ9O75208 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COQ9O75208 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COQ9O75208 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COQ9O75208 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COQ9O75208 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COQ9O75208 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COQ9O75208 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COQ9O75208 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COQ9O75208 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COQ9O75208 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COQ9O75208 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COQ9O75208 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COQ9O75208 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COQ9O75208 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms