Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATP10AO60312 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ATP10AO60312 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ATP10AO60312 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ATP10AO60312 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms