Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KALRNO60229 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KALRNO60229 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KALRNO60229 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KALRNO60229 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KALRNO60229 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KALRNO60229 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KALRNO60229 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KALRNO60229 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KALRNO60229 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KALRNO60229 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KALRNO60229 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KALRNO60229 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KALRNO60229 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KALRNO60229 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KALRNO60229 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KALRNO60229 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KALRNO60229 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KALRNO60229 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KALRNO60229 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KALRNO60229 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KALRNO60229 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KALRNO60229 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KALRNO60229 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KALRNO60229 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KALRNO60229 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KALRNO60229 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KALRNO60229 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KALRNO60229 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KALRNO60229 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KALRNO60229 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KALRNO60229 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KALRNO60229 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KALRNO60229 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KALRNO60229 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KALRNO60229 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KALRNO60229 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KALRNO60229 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KALRNO60229 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KALRNO60229 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KALRNO60229 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KALRNO60229 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KALRNO60229 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KALRNO60229 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KALRNO60229 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KALRNO60229 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KALRNO60229 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KALRNO60229 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KALRNO60229 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KALRNO60229 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KALRNO60229 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KALRNO60229 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KALRNO60229 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KALRNO60229 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KALRNO60229 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KALRNO60229 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KALRNO60229 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KALRNO60229 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KALRNO60229 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KALRNO60229 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KALRNO60229 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KALRNO60229 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KALRNO60229 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KALRNO60229 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KALRNO60229 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KALRNO60229 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KALRNO60229 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KALRNO60229 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KALRNO60229 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KALRNO60229 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KALRNO60229 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KALRNO60229 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KALRNO60229 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KALRNO60229 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KALRNO60229 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KALRNO60229 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KALRNO60229 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KALRNO60229 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KALRNO60229 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KALRNO60229 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KALRNO60229 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KALRNO60229 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KALRNO60229 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KALRNO60229 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KALRNO60229 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KALRNO60229 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms