Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB2O43679 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB2O43679 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB2O43679 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB2O43679 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB2O43679 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB2O43679 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB2O43679 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB2O43679 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDB2O43679 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDB2O43679 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDB2O43679 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDB2O43679 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDB2O43679 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LDB2O43679 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB2O43679 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB2O43679 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDB2O43679 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDB2O43679 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDB2O43679 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDB2O43679 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDB2O43679 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB2O43679 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB2O43679 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB2O43679 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB2O43679 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB2O43679 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB2O43679 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB2O43679 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB2O43679 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB2O43679 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB2O43679 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB2O43679 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB2O43679 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB2O43679 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB2O43679 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB2O43679 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB2O43679 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB2O43679 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB2O43679 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB2O43679 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB2O43679 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB2O43679 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB2O43679 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB2O43679 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB2O43679 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB2O43679 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB2O43679 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB2O43679 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB2O43679 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB2O43679 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB2O43679 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LDB2O43679 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LDB2O43679 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB2O43679 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB2O43679 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB2O43679 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB2O43679 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB2O43679 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB2O43679 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB2O43679 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB2O43679 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms