Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAD1O00515 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAD1O00515 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAD1O00515 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAD1O00515 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAD1O00515 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAD1O00515 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAD1O00515 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAD1O00515 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAD1O00515 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAD1O00515 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAD1O00515 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAD1O00515 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAD1O00515 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAD1O00515 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAD1O00515 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LAD1O00515 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAD1O00515 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAD1O00515 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAD1O00515 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAD1O00515 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAD1O00515 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAD1O00515 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAD1O00515 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LAD1O00515 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAD1O00515 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAD1O00515 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LAD1O00515 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAD1O00515 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAD1O00515 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAD1O00515 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAD1O00515 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAD1O00515 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LAD1O00515 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAD1O00515 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAD1O00515 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAD1O00515 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAD1O00515 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAD1O00515 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAD1O00515 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAD1O00515 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAD1O00515 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAD1O00515 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAD1O00515 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAD1O00515 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAD1O00515 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAD1O00515 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAD1O00515 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAD1O00515 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAD1O00515 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAD1O00515 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms