Protein–RNA interactions for Protein: O00178

GTPBP1, GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1O00178 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTPBP1O00178 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTPBP1O00178 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms