Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PATL2C9JE40 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PATL2C9JE40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PATL2C9JE40 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms