Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA6L9A6NEM1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L9A6NEM1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms