Protein–RNA interactions for Protein: A0A589

TCRBV7S2A1N4T, V_segment translation product (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S2A1N4TA0A589 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCRBV7S2A1N4TA0A589 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCRBV7S2A1N4TA0A589 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCRBV7S2A1N4TA0A589 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms