Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2C4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2C4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0B4J2C4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
A0A0B4J2C4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms