Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
COL4A3BPQ9Y5P4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A3BPQ9Y5P4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms