Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA8Q9Y5G5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGA8Q9Y5G5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA8Q9Y5G5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms