Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCDHB6Q9Y5E3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB6Q9Y5E3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms