Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFSF18Q9UNG2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFSF18Q9UNG2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms