Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRQQ9UN88 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRQQ9UN88 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRQQ9UN88 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRQQ9UN88 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRQQ9UN88 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABRQQ9UN88 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRQQ9UN88 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRQQ9UN88 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms